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Miniconda使用记录(1)

来源:华拓网

下载与安装

wget -c https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh


#安装命令:
chmod 777 Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh #给执行权限
#bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh ##运行询问是否将conda加入环境变量的时候选择no

启动conda:
在上一步选择no之后,输入conda是会报找不到此命令的。cd到miniconda3的bin目录下面,能看到有一个activate。

需要给activate添加一下权限才能使用
chmod 777 activate
启动conda

. ./activate = source ./activate#启动conda
. ./deactivate #退出conda环境

当命令行前面出现(base)的时候说明现在已经在conda的环境中了。这时候输入conda list 命令就有反应了。

conda镜像源

conda config --add channels 
conda config --add channels 
conda config --add channels 
conda config --add channels 

显示安装的频道

 conda config --set show_channel_urls yes 

查看已经添加的channels

conda config --get channels

已添加的channel

vim ~/.condarc

搜索安装命令:

 conda search bwa #查找软件
 conda install bwa #安装软件
 conda remove bwa #卸载软件
 conda update bwa #更新软件